造成胚胎停育的原因有很多，主要分为以下几个方面：
第一，胚胎因素；
第二，遗传因素；
第三，母体因素；
第四，环境因素。
胚胎因素，是指胚胎在发育过程中出现了异常，例如胎儿染色体的发育异常，从而导致了胚胎停育的结局。
遗传因素，包括父母双方染色体或基因的异常。
母体因素，则包括的内容很多，不仅包括母亲患有全身性的疾病，比如糖尿病、高血压、甲状腺疾病、肾病、免疫性疾病、易栓症等。还包括母亲生殖器官的异常，例如子宫畸形、子宫黏膜下肌瘤、子宫内膜薄、子宫内膜炎等，这些都可能会导致胚胎的停育。
环境因素，则是指在胚胎发育的过程中，由于母亲接触到了不良因素，如放射线药物、甲醛等化学物质导致的胚胎停育。
单次的偶发胚胎停育，多是与胚胎染色体的异常是相关的，因此建议在清宫的时候，最好做胚胎染色体检查。如果是两次或者是两次以上的胚胎停育，则建议患者进行全面的系统的检查。比如夫妇双方染色体的检查、女性内分泌的功能检查、免疫指标、抗磷脂综合征、易栓症等相关指标的检查。
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